دوره ۵، شماره ۲ - ( ۱۳۹۳ )                   جلد ۵ شماره ۲ صفحات ۶۷-۵۵ | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Ehsani M, Sepehri M M, Arab S. Analysis of signed biological networks in the perspective of structural balance theory. JMBS 2014; 5 (2) :55-67
URL: http://biot.modares.ac.ir/article-22-4256-fa.html
احسانی مریم، سپهری محمد مهدی، عرب سید شهریار. تحلیل شبکه های زیستی علامت‏ دار از دیدگاه نظریه تعادل ساختاری. زیست‌فناوری مدرس. ۱۳۹۳; ۵ (۲) :۵۵-۶۷

URL: http://biot.modares.ac.ir/article-۲۲-۴۲۵۶-fa.html

تحلیل شبکه های زیستی علامت‏ دار از دیدگاه نظریه تعادل ساختاری
مریم احسانی۱ ، محمد مهدی سپهری* ۲، سید شهریار عرب۳
۱- دانشجوی دکتری،دانشکده مهندسی صنایع و سیستم‌ها ،دانشگاه تربیت مدرس، تهران
۲- دانشیار،دانشکده‌ی مهندسی صنایع و سیستم ‌‌ها،دانشگاه تربیت مدرس
۳- استادیار، گروه بیوفیزیک دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران
چکیده:   (۱۰۸۲۷ مشاهده)
تحلیل شبکه ‏های زیستی علامت‏دار از زمینه ‏های پژوهشی جدید در سال‏های اخیر به شمار می رود. این مقاله به بررسی و مقایسه خوشه‏ های متعادل و انجمن‏های چگال به عنوان دو الگوی ساختاری متفاوت در تحلیل و کشف واحدهای ساختاری موثر در شبکه ‏ها می پردازد. اگرچه بنابر مطالعات موجود شبکه‏ های زیستی به سمت ساختار متعادل گرایش دارند، اما این پژوهش نشان می‏دهد که الگوی انجمن‏های چگال در شبکه های بازنویسی سلول‏هایecoli و yeast از طرح خوشه‏ های متعادل فاصله داشته و تعداد پیوند‏های منفی در آنها به طور معناداری بالا است. این فاصله به عنوان معیاری در ارزیابی و تحلیل ساختار و عملکرد سیستم پیشنهاد می‏شود. همچنین با وجود آنکه اکثریت پیوند‏های بین خوشه ‏های متعادل از نوع منفی می باشد، اما این تحقیق بر نقش پیوند‏های مثبت واسطه بین خوشه ‏های متعادل در پاسخ سیستم تاکید دارد. تحلیل داده ‏های تعدادی شبکه تنظیم ژنی نشان می‏دهد که اغتشاش در وضعیت ژن‏های این پیوندهای واسطه تاثیر مهمی در پاسخ کلی سیستم داشته و سبب ایجاد فاصله بیشتر تعادل جدید از وضعیت اولیه می گردد. به این ترتیب شناسایی خوشه‏ های متعادل و ارتباطات آنها، رویکرد موثری در تعیین واحدهای موثر عملکردی و ارتباطات کلیدی شبکه ‏ها فراهم می کند. این رویکرد در کاربردهایی نظیر هدفگیری ژنی و قطع ارتباطات موثر بین زیرواحدهای اصلی سلولی می تواند مفید واقع شود.
واژه‌های کلیدی: "شبکه‏ های علامت‏دار"، "خوشه متعادل"، "تعادل ساختاری"، "شبکه تنظیم ژنی"
متن کامل [PDF 440 kb]   (۵۲۵۹ دریافت)    
نوع مقاله: مقاله استخراج شده از پایان نامه | موضوع مقاله: بیو فیزیک
دریافت: 1393/9/23 | پذیرش: 1393/12/1 | انتشار: 1394/3/3
ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA
بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.