دوره 12 -شمراه 4- پاییز 1400                   برگشت به فهرست مقالات | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


1- دانشجوی دانشگاه فردوسی مشهد
2- استاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، tahmoorespur@yahoo.com ، tahmoorespur@yahoo.com
چکیده:   (155 مشاهده)
درسال2019 گونه جدیدی از کروناویروس ها در سراسر جهان شایع شد و تاکنون واکسنی که بتواند به طور کامل ایمنی ایجاد نماید تولید نشده است. پروتئین اسپایک کووید19 عامل مهم بیماریزایی آن می باشد. هدف از پژوهش حاضر بررسی اثر پپتید مهندسی شده‌ی لاکتوفرین شتری به نام  clfA- علیه دومین RBD پروتئین اسپایک کووید19است. داکینگ مولکولی پپتید-clfA و پروتئین اسپایک در سرور آنلاین ClusPro2.0 اجرا شد. به منظور بررسی رفتار برهمکنش آنها در زمان های مختلف، مرحله شبیه سازی دینامیک مولکولی در نرم افزار GROMACS2016.4 در مدت زمان 50 نانوثانیه تحت میدان نیروی GROMOS54a7 اجرا شد. نتایج نشان داد پپتیدclfA- به ناحیه هدف اتصال قوی و پایدار برقرار کرده است و ساختار پروتئین اسپایک به سمت ناپایداری رفته است. با از هم باز شدن پیچ خوردگی های پروتئین و افزایش سطح قابل دسترس با حلال مشخص شد که پروتئین در اثر پپتیدclfA- انعطلف پذیرتر و ناپایدارتر شده است. نتایج این پژوهش نشان داد که پپتید clfA- توانست ویژگی های عملکردی این پروتئین را کم یا از بین ببرد. پس می تواند به عنوان یک کاندید مناسب برای مهارکنندگی دومین RBD کرونا ویروس باشد.
     
نوع مقاله: پژوهشي اصيل | موضوع مقاله: بیو انفورماتیک
دریافت: 1400/1/10 | پذیرش: 1400/4/8

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.