جستجو در مقالات منتشر شده
۲ نتیجه برای حدادمشهدریزه
نجمه فرمانبر، علی اکبر حدادمشهدریزه، جعفر همت،
دوره ۸، شماره ۲ - ( ۷-۱۳۹۶ )
چکیده
بیودیزل سوختی پاک، تجدیدپذیر، زیستتخریبپذیر، عاری از گوگرد و ترکیبات آروماتیک با منابع اولیه مشتق از چربیهای حیوانی، گیاهی، جلبکها، قارچها و باکتریها میباشند. درمیان این منابع، قارچهای روغنی با توجه به قابلیت بالای سنتز و تجمع تریآسیلگلیسرول، به عنوان منابع بسیار مطلوب تامین زیست توده بیودیزلی گزارش شدهاند. لذا به منظور ارائه راهکارهایی در جهت افزایش راندمان تولید مبتنی بر فناوریهای نوین زیستی، پایش مکانیسمهای مولکولی مرتبط با تولید و تجمع لیپید در این ارگانیسمها میتواند راهگشا باشد، که در این تحقیق در دستور کار قرار گرفت. به این منظور واکاوی مکانیسمهای مولکولی مرتبط منجربه آشکارسازی آنزیمهای موثر در تولید و تجمع لیپید در گونههای مختلف قارچهای روغنی شد. پایش ویژگیهای ساختاری این ژنها، ضمن ارائه طول و محتوی CG متفاوت، پیوسته بودن تمامی آنها را مشخص نمود. بررسی ویژگیهای ساختاری آنزیمهای مذکور علاوه بر تعیین موقعیت سلولی آنها، حضور دمینهای عملکردی MAO۱_MF، Malic_M و malic را در تمامی آنها با قابلیت تاثیرپذیری از تغییرات پس از ترجمه را نشان داد. تشابهیابی پروتئینی این آنزیمها، منجربه معرفی گونههای قارچی با قابلیت احتمالی تولید چربی شد. از سویی دیگر، مدلسازی ساختاری آنزیمها و شبه آنزیمهای مالیک انتخابی ضمن ایجاد مدلهای ساختاری مناسب، کیفیت و کارایی مطلوب آنها در اتصال به مالات را آشکار نمود. به طورکلی، نتایج حاصل از این تحقیق ضمن معرفی گونههای قارچی مناسب در تامین زیست توده بیودیزلی، منجربه معرفی آنزیمهای موثر با ویژگیهای خاص شد که میتواند در ردیابی سویههای توانا در تولید بیودیزل و یا تراریختسازی مفید واقع گردد.
راضیه صباغ، علی اکبر حدادمشهدریزه، سمانه دولت آبادی،
دوره ۱۰، شماره ۲ - ( بهار ۱۳۹۸ )
چکیده
ایمنوتوکسینها با قابلیت هدفگذاری هوشمند و القای مرگ سلولهای سرطانی مبتنی بر حضور لیگاند اختصاصی مرتبط با آنتیژن و بخش توکسینی راهکاری اساسی در درمان بیماریهای سرطانی هستند. بنابراین آشکارسازی آنتیژنهای اختصاصی سطح سلولهای سرطانی و اجزای تشکیلدهنده این نوع از داروها و سرهمبندی آنها مبتنی بر لینکرهای پپتیدی گام اساسی در طراحی این نوع از داروها است که در این تحقیق مبتنی بر علم محاسبات در ارتباط با سرطان تخمدان در دستور کار قرار گرفته است. نتایج حاصل از این تحقیق در گام نخست، منجر به آشکارسازی ۲۹ آنتیژن با قابلیت بیان در سطح سلولهای سرطانی تخمدان با بیشترین و اختصاصیترین بیان در ارتباط با آنتیژنهای MAGE۴ و CA۱۲۵ شد. مدل ساختاری MAGE۴ تعیین و الگوی بیانی آن بر سطح غشای مبتنی بر حضور پروتئینهای HLA تعیین شد. از سویی دیگر، بین مولکولهای پروتئینی قابل اتصال به این آنتیژن TRIM۶۹ بهعنوان کارآمدترین لیگاندها انتخاب شد. در ادامه، سرهمبندی دمین توکسینی مشتق از کورینه باکتریوم دیفتری به لیگاند انتخابی با استفاده از لینکر (GGGGS)۳ در ۵ حالت مختلف منجر به ایجاد ۵۰ سازه نوترکیب با کیفیت و ساختار متفاوت شد که در این میان مدل ساختاری داروی پروتئینی کدشده از سازه S۴، بهترین پایداری ساختاری و عملکردی از دیدگاه میل اتصالی و ایمنوژنسیتی پس از قرارگیری در شرایط شبهواقعی را نشان داد. بهطور کلی نتایج حاصل از این تحقیق منجر به معرفی آنتیژن MAGE۴ بهعنوان نامزدی مناسب در اهداف داروهای ایمنوتوکسینی موثر بر علیه تخمدان و طراحی ایمنوتوکسینی موثر بر این آنتیژن با قابلیت مطلوب ساختاری و عملکردی شد که باید مورد آزمونهای آزمایشگاهی قرار گیرد.