دوره 1، شماره 1 - ( 1389 )                   جلد 1 شماره 1 صفحات 10-1 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Arab S S, Sadeghi M, ESlahchi C, Pezeshk H. Prediction of flexibility in proteins based on sequence of amino acids. JMBS 2010; 1 (1) :1-10
URL: http://biot.modares.ac.ir/article-22-10583-fa.html
عرب سید شهریار، صادقی مهدی، اصلاح چی چنگیز، پزشک حمید. پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی با استفاده از پروفایل انرژی. زیست‌فناوری مدرس. 1389; 1 (1) :1-10

URL: http://biot.modares.ac.ir/article-22-10583-fa.html

پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی با استفاده از پروفایل انرژی
سید شهریار عرب* 1، مهدی صادقی2 ، چنگیز اصلاح چی3 ، حمید پزشک4
1- نیاوران - میدان شهید باهنر - پژوهشگاه تحقیقات بنیادی (IPM) - پژوهشکده کامپیوتر - گروه بیوانفورماتیک، Tehran
2- اتوبان تهران - کرج - پژوهشگاه ژنتیک - صندوق پستی ۱۴۱۵۵-۶۳۴۳، تهران
3- دانشگاه شهید بهشتی دانشکده ریاضی صندوق پستی ۱۹۸۳۹۶۳۱۱۳، تهران
4- دانشگاه تهران، دانشکده ریاضی آمار و علوم کامپیوتر، قطب بیومت، تهران
چکیده:   (12238 مشاهده)
در این مقاله پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی بر پایه توالی اسید های آمینه آن ارائه خواهد شد. برای تعریف فاکتوری به منظور تشخیص میزان انعطاف پذیری از انرژی دو اسید آمینه متوالی استفاده شد. با استفاده از تحلیل‌ های آماری برروی این انرژی، عددی بین صفر و صد به هر جفت اسید آمینه تعلق می‌گیرد که آنرا عدد انعطاف پذیری می‌ نامیم. در نظر گرفتن اثرات همسایه‌ ها تا چهار همسایه اسید آمینه باعث بهبود پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئین می‌گردد. برای ارزیابی پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی از پروتئین‌ هایی که ساختمان آنها توسط NMR تعیین ساختار شده بود استفاده شد. عدم قطعیت در تعیین ساختار مناطقی که انعطاف پذیری بالایی دارند، مثل سر و ته زنجیره و حلقه‌ها باعث ایجاد مدل‌های مختلف ساختمانی می‌شود. مقایسه بین پیشگویی و پراکندگی زوایا در مدل‌های مختلف همبستگی بالایی را نشان می‌دهد که حاکی از دقت قابل اعتماد روش پیشگویی می‌باشد.
واژه‌های کلیدی: انعطاف پذیری ساختمانی، پیشگویی عملکرد پروتئین، پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئین، پیشگویی ساختمان پروتئین
متن کامل [PDF 373 kb]   (6114 دریافت)    
نوع مقاله: کوتاه پژوهشی | موضوع مقاله: Agricultural Machinery
دریافت: 1389/5/12 | پذیرش: 1389/8/4 | انتشار: 1389/9/22
ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA
بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.