دوره 12، شماره 1 - ( 1399 )                   جلد 12 شماره 1 صفحات 101-89 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Mortazavi S S, Gharbi S, Shahali M. Bioinformatics Prediction of microRNAs Regulating Epithelial-to-Mesenchymal Transition in Cancer Cells. JMBS 2020; 12 (1) :89-101
URL: http://biot.modares.ac.ir/article-22-39000-fa.html
مرتضوی صدیقه سادات، غربی* صدیقه، شاه علی* مریم. پیش بینی بیوانفورماتیکی microRNA های تنظیم کننده فرایند EMT در سلول های سرطانی. زیست‌فناوری مدرس. 1399; 12 (1) :89-101

URL: http://biot.modares.ac.ir/article-22-39000-fa.html


1- ﮔﺮوه زیست ﺷﻨﺎﺳﯽ، دانشکده علوم پایه،دانشگاه شهید باهنر کرمان
2- ﮔﺮوه زیست ﺷﻨﺎﺳﯽ، دانشکده علوم پایه،دانشگاه شهید باهنر کرمان ، Gharbi@uk.ac.ir
3- بخش کنترل کیفیت، مجتمع تولیدی تحقیقاتی انستیتو پاستور ایران ، m_shahali@pasteur.ac.ir
چکیده:   (1176 مشاهده)

هدف: EMT فرایندی برگشت­پذیر و ضروری در طول جنین‌زایی، بهبود زخم و پیشرفت سرطان است. در بسیاری از سرطانها، EMT می‌تواند ویژگی­های تهاجمی تومور را افزایش دهد. اخیراً miRNAها بهعنوان کلاس جدیدی از‌RNA های غیر کدکننده­ تنظیم­گر بیان ژن در مراحل پس از ترجمه دخیل در فرایندEMT   شناخته می­شوند. بـااینحال، مکانیسم و اثر دقیق miRNAها در فرایند EMT در سلولهای سرطانی انسان هنوز به‌خوبی مشخص نیست. این مطالعه با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک پیشبینیکننده miRNAهای تنظیم‌کننده ژنهای اصلی در فرایندEMT ، تلاش می‌کند نقش miRNAها را در فرایند EMT روشن کند.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه، با استفاده از پایگاه‌های داده­های تحت وب و ابزارهای پیش‌بینی برهمکنش miRNAها نظیر DIANA، TargetScan و miRSystem، برهمکنشmiRNAهای تنظیم‌کننده ژن­های N-cadherin ، TWIST1، ZEB1، SNAIL و Vimentin به عنوان بیومارکرهای اصلی سلول‌های مزانشیمی بررسی شد.
نتایج: اثرات miRNAهای متفاوت براساس الگوریتم هر پایگاه بر ژن‌های نامزد بررسی و دادههای به‌دست‌آمده از پایگاههای مختلف باهم اشتراک گرفته شد. نتایج نشان داد که یازده miRNA با احتمال بالا به‌طورمشترک می­توانند در فرایند EMT/MET نقش داشته باشند.
ﻧﺘﯿﺠﻪ‌ﮔﯿﺮی: براساس یافتههای ما، می­توان پیشبینی کرد که با توجه به نمره بالاmiRNA های انتخابشده با ژنهای نامزد، این miRNAها می­توانند نقشی مهم در فرایند EMT/MET داشته باشد. ازاینرو، میتوان از آنها بهعنوان کاندیدهای مناسب برای تحقیقات بالینی آینده استفاده کرد.
 
کلمات کلیدی: EMT،MET ، TargetScan، miRSystem، microRNA

واژه‌های کلیدی: EMT، MET، TargetScan، miRSystem، microRNA
متن کامل [PDF 780 kb]   (483 دریافت)    
نوع مقاله: پژوهشی اصیل | موضوع مقاله: بیو انفورماتیک
دریافت: 1398/9/23 | پذیرش: 1399/8/10 | انتشار: 1399/10/10

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.