دوره 9، شماره 1 - ( 1396 )                   جلد 9 شماره 1 صفحات 144-137 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Jookar kashi F, Owlia P, Amoozegar M. Evaluation of Prokaryotic Diversity in Hypersaline Environment by Culture-independent Method. JMBS 2018; 9 (1) :137-144
URL: http://biot.modares.ac.ir/article-22-24321-fa.html
جوکار کاشی فرشته، اولیا پرویز، آموزگار محمدعلی. بررسی تنوع پروکاریوت‌های اکوسیستم شور به روش غیرقابل کشت. زیست‌فناوری مدرس. 1396; 9 (1) :137-144

URL: http://biot.modares.ac.ir/article-22-24321-fa.html


1- گروه بیوتکنولوژی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، کاشان، ایران، کاشان، کیلومتر 6 بلوار قطب راوندی، دانشگاه کاشان. کد پستی: 873175315 ، Jookar@kashanu.ac.ir
2- مرکز تحقیقات میکروب‌شناسی ملکولی، دانشگاه شاهد، تهران ،ایران
3- گروه میکروبیولوژی، دانشکده زیست‌شناسی و قطب تبارزایی موجودات زنده، دانشگاه تهران، تهران، ایران
چکیده:   (3592 مشاهده)
اهداف: میکروارگانیزم‌ها علاوه بر محیط‌های معمولی در محیط‌های افراطی هم حضور دارند. دریاچه‌های نمک با شوری در حد اشباع در سراسر جهان پراکنده‌ هستند. یکی از این محیط‌های پرشور دریاچه ارومیه است. هدف مطالعه حاضر بررسی تنوع پروکاریوت‌های اکوسیستم شور دریاچه ارومیه به روش غیرقابل کشت بود.
مواد و روش‌ها: در پژوهش تجربی حاضر از مناطق مختلف دریاچه ارومیه نمونه‌برداری شد و ماده ژنومی استخراج‌شده از نمونه آب شاخص به‌عنوان الگو برای تکثیر قطعه ۱۶S rDNA و قطعه‌ای از ژن bop از طریق واکنش زنجیره‌ای پلیمراز مورد استفاده قرار گرفت. با روش کلونینگ هر یک از قطعات تکثیرشده که مربوط به یک سویه منفرد بودند توسط کیت T/A وکتور تکثیر یافتند. برای بررسی بیشتر تنوع زیستی هالوآرکی‌ها به‌موزات بررسی ۱۶S rDNA، تنوع زیستی ژن bop نیز مطالعه شد.
یافته‌ها: با روش کلونینگ و توالی‌یابی شش جنس باکتری شامل آکاریوکلوریس، ادهیری‌باکتر، براکی‌باکتریوم، گلوئوکپسوپسیز، سیزری‌باکتر و باسیلوس شناسایی شدند. کتابخانه ژنی آرکی‌ها متعلق به پنج جنس شامل هالونوتیوس، هالولامینا، هالوکوادراتوم، هالومیکروآرکولا و هالورهابدوس بودند. کتابخانه کلون‌های باکتریایی نیز در چهار راسته باکتریوئیدز، سیانوباکتر، اکتینوباکتر و فرمیتیکوس قرار داشتند. ‌کلون‌های کتابخانه قطعه‌ای از ژن bop (به عنوان یک مارکر مولکولی) متعلق به چهار جنس شامل هالوروبروم، نتری‌آلبا، هالوکوادراتوم و نترینما بودند. فیلوژنی bop با فیلوژنی ۱۶S rDNA رابطه تنگاتنگی نشان داد.
نتیجه‌گیری: با روش کلونینگ و توالی‌یابی شش جنس باکتری شامل آکاریوکلوریس، ادهیری‌باکتر، براکی‌باکتریوم، گلوئوکپسوپسیز، سیزری‌باکتر و باسیلوس شناسایی شدند. فیلوژنی bop با فیلوژنی ۱۶S rDNA رابطه تنگاتنگی دارد.
واژه‌های کلیدی: محیط پرشور، ژن bop، متاژنوم، هالوآرکی
متن کامل [PDF 1004 kb]   (2655 دریافت)    
موضوع مقاله: بیوتکنولوژی کشاورزی
دریافت: 1396/1/20 | پذیرش: 1396/7/30 | انتشار: 1369/12/29

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.